Titre :	Recherche des souches bactériennes pathogènes du genre VIBRIO dans les produits de la pêche et dans l'environnement au Sénégal
Type de document :	texte imprimé
Auteurs :	Ignace Coly, Auteur
Editeur :	Dakar : ED-SEV / UCAD
Année de publication :	2014
Importance :	142 p.
Langues :	Français (fre)
Catégories :	THESES DE DOCTORAT SCIENCES DE LA VIE, DE LA SANTE ET DE L'ENVIRONNEMENT:2014
Mots-clés :	PRODUIT DE LA PECHE  POISSON  VIBRIO  VIBRIO CHOLERAE  BACTERIE
Index. décimale :	TED-THESE ECOLE DOCTORALE
Résumé :	Ces quinze dernières années, la détection de souches pathogènes de Vibrio spp dans les produits halieutiques Sénégalais présentés dans le marché de l’Union Européenne a déclenché cinq alertes sanitaires. Les travaux de recherche de cette thèse portent d’une part, sur la présence de souches bactériennes pathogènes de Vibrio spp sur les produits halieutiques destinés à l’exportation et d’autre part, sur une surveillance environnementale de ces espèces bactériennes présentes dans les écosystèmes marins et estuariens. L’étude comprend deux parties : ►Une première partie réalisée dans une entreprise spécialisée dans le traitement et l’exportation de produits halieutiques où l’étude a été menée de 2005 à 2007. Nous avons utilisé la méthode ISO 8914 pour rechercher les souches pathogènes de Vibrio spp dans les produits finis destinés à l’exportation. Sur un total de 101 échantillons analysés (crevette entière, crevette décortiquée, filet de sole et filet de rouget), Vibrio parahaemolyticus a été détecté dans 6,9% des échantillons. Aucune souche de V. cholerae n’a été détectée. Le taux de présence de Vibrio parahaemolyticus (6,9%) sur le produit fini avait été jugé élevé, même si la PCR a révélé qu’aucune de ces souches n’était porteuse de gènes de virulence tdh et/ou trh. Le procédé de fabrication a alors été modifié dans le but de réduire le taux de Vibrio parahaemolyticus présent sur le produit fini. Après modification du procédé, les contrôles effectués sur 35 échantillons de produits finis se sont tous caractérisés par une absence de Vibrio parahaemolyticus dès l’étape de l’isolement bactériologique (sur TCBS et CHROMagar Vibrio). Ce qui est révélateur de l’importance de l’autocontrôle comme outil de vérification du plan HACCP et de validation des procédés de fabrication. ►Une deuxième partie, qui est une étude environnementale, a été conduite de 2007 à 2009 pour évaluer la présence et l’abondance de Vibrio cholerae et Vibrio parahaemolyticus dans les produits halieutiques et dans les eaux marines et estuariennes. 123 échantillons de produits halieutiques ont été prélevés dans différentes zones de pêche et dans deux grands marchés de Dakar, tandis que 52 échantillons d’eau ont été récoltés dans différentes régions océaniques et estuariennes du pays. Vibrio parahaemolyticus a été détecté dans 30,1% des échantillons de produits halieutiques contre seulement 1,6% pour Vibrio cholerae. Dans les échantillons d’eau, Vibrio parahaemolyticus et Vibrio cholerae ont été détectés respectivement dans 28,8% et 5,7% des échantillons. L’abondance de Vibrio parahaemolyticus dans les produits halieutiques en provenance des zones de pêche variait de < 0,3 à 7,5 NPP/g. Dans les échantillons en provenance des marchés, les densités de V. parahaemolyticus ont révélé des valeurs NPP élevées allant de 0,61 à > 110 NPP/g. Les densités de Vibrio cholerae dans les deux échantillons de produits halieutiques positifs atteignaient les valeurs respectives de 0,36 et 0,61 NPP/g. L’analyse PCR a révélé que les souches de Vibrio parahaemolyticus isolées possédaient le gène tlh mais non les gènes tdh et trh. Toutes les souches de Vibrio cholerae isolées étaient non-O1 et non-O139. Ces résultats suggèrent que les salinités élevées au niveau des environnements marins et estuariens du Sénégal limitent l’occurrence de Vibrio parahaemolyticus et Vibrio cholerae, malgré les températures élevées prévalant dans les eaux pendant toute l’année. Par ailleurs, la rupture de chaine de froid constatée lors de la commercialisation des produits halieutiques dans les marchés peut constituer un risque majeur lié à une prolifération post récolte des Vibrio pathogènes.
PRESIDENT DE JURY :	SAWADOGO Germain: Professeur Ecole Inter-Etats des Sciences et Médecine Vétérinaires (EISMV)
DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE :	SEYDI Malang :Professeur Ecole Inter-Etats des Sciences et Médecine Vétérinaires (EISMV)
RAPPORTEUR :	PIARROUX Renaud : Professeur Faculté Médecine de la Timone, Aix Marseille Université/ MANGA Noël Magloire: Maitre de conférences agrégé Université A. S. Ziguinchor/DEMAGNY Guillaume : Chargé de recherche, IRD, Montpellier
CO-DIRECTEUR :	GASSAMA SOW Amy : Maître de conférences agrégée E. S. P Dakar/MARTINEZ-URTAZA Jaime : Université S. de Compostelle, Santiago, Espagne
EXAMINATEUR :	BOYE Cheikh S-B: Professeur Université Cheikh Anta Diop de Dakar (UCAD)
DATE DE SOUTENANCE :	06/12/2014
PAYS :	Sénégal
Permalink :	https://cid.eismv.org/pmb/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=4725

Recherche des souches bactériennes pathogènes du genre VIBRIO dans les produits de la pêche et dans l'environnement au Sénégal [texte imprimé] / Ignace Coly, Auteur . - Dakar : ED-SEV / UCAD, 2014 . - 142 p.
Langues : Français (fre)

Catégories :	THESES DE DOCTORAT SCIENCES DE LA VIE, DE LA SANTE ET DE L'ENVIRONNEMENT:2014
Mots-clés :	PRODUIT DE LA PECHE  POISSON  VIBRIO  VIBRIO CHOLERAE  BACTERIE
Index. décimale :	TED-THESE ECOLE DOCTORALE
Résumé :	Ces quinze dernières années, la détection de souches pathogènes de Vibrio spp dans les produits halieutiques Sénégalais présentés dans le marché de l’Union Européenne a déclenché cinq alertes sanitaires. Les travaux de recherche de cette thèse portent d’une part, sur la présence de souches bactériennes pathogènes de Vibrio spp sur les produits halieutiques destinés à l’exportation et d’autre part, sur une surveillance environnementale de ces espèces bactériennes présentes dans les écosystèmes marins et estuariens. L’étude comprend deux parties : ►Une première partie réalisée dans une entreprise spécialisée dans le traitement et l’exportation de produits halieutiques où l’étude a été menée de 2005 à 2007. Nous avons utilisé la méthode ISO 8914 pour rechercher les souches pathogènes de Vibrio spp dans les produits finis destinés à l’exportation. Sur un total de 101 échantillons analysés (crevette entière, crevette décortiquée, filet de sole et filet de rouget), Vibrio parahaemolyticus a été détecté dans 6,9% des échantillons. Aucune souche de V. cholerae n’a été détectée. Le taux de présence de Vibrio parahaemolyticus (6,9%) sur le produit fini avait été jugé élevé, même si la PCR a révélé qu’aucune de ces souches n’était porteuse de gènes de virulence tdh et/ou trh. Le procédé de fabrication a alors été modifié dans le but de réduire le taux de Vibrio parahaemolyticus présent sur le produit fini. Après modification du procédé, les contrôles effectués sur 35 échantillons de produits finis se sont tous caractérisés par une absence de Vibrio parahaemolyticus dès l’étape de l’isolement bactériologique (sur TCBS et CHROMagar Vibrio). Ce qui est révélateur de l’importance de l’autocontrôle comme outil de vérification du plan HACCP et de validation des procédés de fabrication. ►Une deuxième partie, qui est une étude environnementale, a été conduite de 2007 à 2009 pour évaluer la présence et l’abondance de Vibrio cholerae et Vibrio parahaemolyticus dans les produits halieutiques et dans les eaux marines et estuariennes. 123 échantillons de produits halieutiques ont été prélevés dans différentes zones de pêche et dans deux grands marchés de Dakar, tandis que 52 échantillons d’eau ont été récoltés dans différentes régions océaniques et estuariennes du pays. Vibrio parahaemolyticus a été détecté dans 30,1% des échantillons de produits halieutiques contre seulement 1,6% pour Vibrio cholerae. Dans les échantillons d’eau, Vibrio parahaemolyticus et Vibrio cholerae ont été détectés respectivement dans 28,8% et 5,7% des échantillons. L’abondance de Vibrio parahaemolyticus dans les produits halieutiques en provenance des zones de pêche variait de < 0,3 à 7,5 NPP/g. Dans les échantillons en provenance des marchés, les densités de V. parahaemolyticus ont révélé des valeurs NPP élevées allant de 0,61 à > 110 NPP/g. Les densités de Vibrio cholerae dans les deux échantillons de produits halieutiques positifs atteignaient les valeurs respectives de 0,36 et 0,61 NPP/g. L’analyse PCR a révélé que les souches de Vibrio parahaemolyticus isolées possédaient le gène tlh mais non les gènes tdh et trh. Toutes les souches de Vibrio cholerae isolées étaient non-O1 et non-O139. Ces résultats suggèrent que les salinités élevées au niveau des environnements marins et estuariens du Sénégal limitent l’occurrence de Vibrio parahaemolyticus et Vibrio cholerae, malgré les températures élevées prévalant dans les eaux pendant toute l’année. Par ailleurs, la rupture de chaine de froid constatée lors de la commercialisation des produits halieutiques dans les marchés peut constituer un risque majeur lié à une prolifération post récolte des Vibrio pathogènes.
PRESIDENT DE JURY :	SAWADOGO Germain: Professeur Ecole Inter-Etats des Sciences et Médecine Vétérinaires (EISMV)
DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE :	SEYDI Malang :Professeur Ecole Inter-Etats des Sciences et Médecine Vétérinaires (EISMV)
RAPPORTEUR :	PIARROUX Renaud : Professeur Faculté Médecine de la Timone, Aix Marseille Université/ MANGA Noël Magloire: Maitre de conférences agrégé Université A. S. Ziguinchor/DEMAGNY Guillaume : Chargé de recherche, IRD, Montpellier
CO-DIRECTEUR :	GASSAMA SOW Amy : Maître de conférences agrégée E. S. P Dakar/MARTINEZ-URTAZA Jaime : Université S. de Compostelle, Santiago, Espagne
EXAMINATEUR :	BOYE Cheikh S-B: Professeur Université Cheikh Anta Diop de Dakar (UCAD)
DATE DE SOUTENANCE :	06/12/2014
PAYS :	Sénégal
Permalink :	https://cid.eismv.org/pmb/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=4725