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Analyse du polymorphisme des microsatellites / Poutya Epouse Saïzonou Marie-Rose (2008) 

Public ISBD Titre : Analyse du polymorphisme des microsatellites : application a la des chèvres naines et du Sahel d’Afrique de l’Ouest Type de document : texte imprimé Auteurs : Poutya Epouse Saïzonou Marie-Rose, Auteur Editeur : Dakar : EISMV Année de publication : 2008 Importance : 90 p. Note générale : Langues : Français (fre) Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2008 Mots-clés : CHEVRE  CAPRIN  MARQUEUR GENETIQUE  MICROSATELLITE  GENETIQUE Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : L’importance numérique des ressources caprines africaines est associée à une forte diversité génétique. Les marqueurs génétiques tels que les microsatellites sont l’une des voies d’investigation pour améliorer la connaissance des ressources génétiques animales. Toutefois, si en Afrique ces outils ont été utilisés chez les bovins, leur utilisation chez les caprins est limitée à quelques populations. Il est donc nécessaire d'étendre ces études à d'autres populations d'Afrique de l'Ouest afin de mieux cerner la diversité des ressources génétiques. La présente étude qui vise à analyser le polymorphisme des microsatellites et à évaluer leur efficacité dans la différenciation des populations de chèvres étudiées s’est déroulée à Dakar de Mars à Juillet 2007. Elle a porté sur 9 populations de chèvres : les chèvres Djallonké du Togo, du Ghana, et du Sénégal ; la chèvre Kirdi du Tchad, la chèvre Mossi du Burkina-Faso, la chèvre Laobé de la Guinée; les chèvres du Sahel du Mali, de la Mauritanie et du Tchad. Les résultats montrent qu’il existe une grande diversité génétique caprine en Afrique de l’Ouest. Les dix marqueurs microsatellites ont affiché un polymorphisme génétique très marqué (en moyenne 11 allèles différents). Ils ont montré un faible niveau de croisements non panmictiques à l’intérieur des populations (FIS=0,065). Les valeurs des hétérozygoties observées (Ho) bien qu’étant élevées (0,602±0,1641 à 0,725±0,1662) demeurent faibles par rapport à celles attendues théoriquement Ht (0,6031± 0,1080 à 0,7278±0,1247). Les populations de chèvres étudiées ne sont donc pas en équilibre de Hardy Weinberg et présentent un déficit global en hétérozygotes. La différenciation génétique entre les populations de chèvres étudiées est modérée (FST=0,062). Les marqueurs microsatellites utilisés ont permis de séparer nettement les chèvres Djallonké du Ghana des autres populations de chèvres naines. Ils ont regroupé au sein d’une même population d’une part les chèvres Djallonké de Kolda (Sénégal) et Laobé de Fouta Djallon (Guinée), et d’autre part les chèvres Djallonké du Togo et du Burkina-Faso. L’affinité entre les chèvres Kirdi et les chèvres du Sahel du Tchad a été également établie. Malgré la proximité géographique entre le Mali et la Mauritanie, la présente étude nous a permis de distinguer génétiquement les populations de chèvres du Sahel de ces deux pays. PRESIDENT DE JURY : Mme SECK Sylvie GASSAMA DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Monsieur MISSOHOU Ayao RAPPORTEUR : M AKAKPO Ayayi Justin MEMBRE : Monsieur SAWADOGO Germain Jérôme /Monsieur KABORET Yalacé Yamba DATE DE SOUTENANCE : 22/03/2008 PAYS : BENIN Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=1547 Analyse du polymorphisme des microsatellites : application a la des chèvres naines et du Sahel d’Afrique de l’Ouest [texte imprimé] / Poutya Epouse Saïzonou Marie-Rose, Auteur . - Dakar : EISMV, 2008 . - 90 p. Langues : Français (fre) Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2008 Mots-clés : CHEVRE  CAPRIN  MARQUEUR GENETIQUE  MICROSATELLITE  GENETIQUE Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : L’importance numérique des ressources caprines africaines est associée à une forte diversité génétique. Les marqueurs génétiques tels que les microsatellites sont l’une des voies d’investigation pour améliorer la connaissance des ressources génétiques animales. Toutefois, si en Afrique ces outils ont été utilisés chez les bovins, leur utilisation chez les caprins est limitée à quelques populations. Il est donc nécessaire d'étendre ces études à d'autres populations d'Afrique de l'Ouest afin de mieux cerner la diversité des ressources génétiques. La présente étude qui vise à analyser le polymorphisme des microsatellites et à évaluer leur efficacité dans la différenciation des populations de chèvres étudiées s’est déroulée à Dakar de Mars à Juillet 2007. Elle a porté sur 9 populations de chèvres : les chèvres Djallonké du Togo, du Ghana, et du Sénégal ; la chèvre Kirdi du Tchad, la chèvre Mossi du Burkina-Faso, la chèvre Laobé de la Guinée; les chèvres du Sahel du Mali, de la Mauritanie et du Tchad. Les résultats montrent qu’il existe une grande diversité génétique caprine en Afrique de l’Ouest. Les dix marqueurs microsatellites ont affiché un polymorphisme génétique très marqué (en moyenne 11 allèles différents). Ils ont montré un faible niveau de croisements non panmictiques à l’intérieur des populations (FIS=0,065). Les valeurs des hétérozygoties observées (Ho) bien qu’étant élevées (0,602±0,1641 à 0,725±0,1662) demeurent faibles par rapport à celles attendues théoriquement Ht (0,6031± 0,1080 à 0,7278±0,1247). Les populations de chèvres étudiées ne sont donc pas en équilibre de Hardy Weinberg et présentent un déficit global en hétérozygotes. La différenciation génétique entre les populations de chèvres étudiées est modérée (FST=0,062). Les marqueurs microsatellites utilisés ont permis de séparer nettement les chèvres Djallonké du Ghana des autres populations de chèvres naines. Ils ont regroupé au sein d’une même population d’une part les chèvres Djallonké de Kolda (Sénégal) et Laobé de Fouta Djallon (Guinée), et d’autre part les chèvres Djallonké du Togo et du Burkina-Faso. L’affinité entre les chèvres Kirdi et les chèvres du Sahel du Tchad a été également établie. Malgré la proximité géographique entre le Mali et la Mauritanie, la présente étude nous a permis de distinguer génétiquement les populations de chèvres du Sahel de ces deux pays. PRESIDENT DE JURY : Mme SECK Sylvie GASSAMA DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Monsieur MISSOHOU Ayao RAPPORTEUR : M AKAKPO Ayayi Justin MEMBRE : Monsieur SAWADOGO Germain Jérôme /Monsieur KABORET Yalacé Yamba DATE DE SOUTENANCE : 22/03/2008 PAYS : BENIN Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=1547

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