Caractérisation phénotypique et génotypique de l’antibiorésistance et de la virulence des souches de Staphylococcus aureus isolées des mammites bovines et en milieu hospitalier à Dakar (Sénégal) / Pape Jean Paul BAKHOUM (2022) 

Public ISBD Titre : Caractérisation phénotypique et génotypique de l’antibiorésistance et de la virulence des souches de Staphylococcus aureus isolées des mammites bovines et en milieu hospitalier à Dakar (Sénégal) Type de document : texte imprimé Auteurs : Pape Jean Paul BAKHOUM, Auteur Editeur : Dakar : EISMV Année de publication : 2022 Importance : 101 p. Langues : Français (fre) Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2022 Mots-clés : ANTIBIORESISTANCE  STAPHYLOCOCCUS AUREUS  MAMMITE BOVINE  DAKAR Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : La présente étude a cherché à faire une caractérisation phénotypique et génotypique de l’antibiorésistance et de la virulence des souches de S. aureusisolées du lait de mammitesbovineset en milieu hospitalier à Dakar(Sénégal). Sur un total de 100 échantillons de lait de vaches atteintes de mammites dans six sites de production laitiers de la zone péri-urbaine de Dakar, 52bactériesont été isolées dont 8 hémolytiques (15,40%).L’identification réalisée à partir des tests biochimiques (Chapman/Mannitol, Coagulase et DNase) a donné 28 souches de S. aureussoit 53,80%dont 3 issues des mammites cliniques (5,80%) et 25 des mammites subcliniques (48%). Parmi ces 28 souches de S. aureus, les 6 sont hémolytiques (hémolyse béta) soit 21,40% et proviennent toutes des isolats issus des vaches atteintes de mammites subcliniques. Quant aux souches hospitalières collectées par l’Hôpital d’Enfants Albert ROYER, 42 sur 216 bactéries ont été identifiées comme remplissant tous les critères d’identification des S. aureussoit 19,44%. Ces souches ont été isolées à 73,81% du pus, à 11,90% d’hémoculture, à 4,76% du liquide-céphalorachidien (LCR), et à 2,38% d’urine ainsi que du liquide pleural (LP).Letest de sensibilité aux antibiotiquesréalisé sur 28 souchesanimales et 42 souches hospitalièresde S. aureusa été déterminé par la méthode de diffusion des disques en milieu gélosé. La lecture de l’antibiogrammefaite selon les normes du CA-SFM/EUCAST (2020)a montré que toutes les 28 souches de S. aureusd’origine animale testées sont sensibles au Chloramphénicol et au Cotrimoxazole. Alors que 46,40% des souches sont résistantes à la Pénicilline, 35,70% à la Fosfomycine, 17,90% à la Tobramycine, 14,30% à la Gentamicine et à la Kanamycine, 7,14% à la Lincomycine et à la Norfloxacine, 10,70% à l’Acide fusidique et à la Rifampicine puis 3,60% à la Ciprofloxacine, à la Céfoxitine et à l’Erythromycine. En ce qui concerne lessouches hospitalières, aucune résistance n’a été notée avec le Chloramphénicol, la Lincomycine, l’Ofloxacineet la Rifampicine. Le plus grand nombre de résistancea étéobservé avec la pénicilline G (73,80%). La résistance aux autres antibiotiquesà savoir Oxacilline (14,30%), Céfoxitine (7,10%), Kanamycine (4,80%), Tobramycine (14,30%), Gentamicine (11,90%), Erythromycine (9,50%;), Ciprofloxacine (4,80%), Norfloxacine, Acide fusidique (11,90%), Vancomycine (2,40%) ne dépasse pas 15% à l’exception du Triméthoprime-sulfaméthoxazole (54,80%) et de la Fosfomycine (59,50%). La recherche des gènesde virulencePvlet de résistance MecApar PCR en temps réel a montré que toutes les souches hospitalières (100%) de S. aureusexpriment le gène pvlcontre 84,35% des souches animales; tandisque 12 souches humaines soit 28,57 % et 4des souches animales soit 11,76 %possédaientle gène MecA. PRESIDENT DE JURY : M. Emmanuel BASSENE DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI RAPPORTEUR : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI MEMBRE : Mme Mireille Catherine KADJA WONOU DATE DE SOUTENANCE : 01/07/2022 PAYS : Sénégal Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=5046 Caractérisation phénotypique et génotypique de l’antibiorésistance et de la virulence des souches de Staphylococcus aureus isolées des mammites bovines et en milieu hospitalier à Dakar (Sénégal) [texte imprimé] / Pape Jean Paul BAKHOUM, Auteur . - Dakar : EISMV, 2022 . - 101 p. Langues : Français (fre) Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2022 Mots-clés : ANTIBIORESISTANCE  STAPHYLOCOCCUS AUREUS  MAMMITE BOVINE  DAKAR Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : La présente étude a cherché à faire une caractérisation phénotypique et génotypique de l’antibiorésistance et de la virulence des souches de S. aureusisolées du lait de mammitesbovineset en milieu hospitalier à Dakar(Sénégal). Sur un total de 100 échantillons de lait de vaches atteintes de mammites dans six sites de production laitiers de la zone péri-urbaine de Dakar, 52bactériesont été isolées dont 8 hémolytiques (15,40%).L’identification réalisée à partir des tests biochimiques (Chapman/Mannitol, Coagulase et DNase) a donné 28 souches de S. aureussoit 53,80%dont 3 issues des mammites cliniques (5,80%) et 25 des mammites subcliniques (48%). Parmi ces 28 souches de S. aureus, les 6 sont hémolytiques (hémolyse béta) soit 21,40% et proviennent toutes des isolats issus des vaches atteintes de mammites subcliniques. Quant aux souches hospitalières collectées par l’Hôpital d’Enfants Albert ROYER, 42 sur 216 bactéries ont été identifiées comme remplissant tous les critères d’identification des S. aureussoit 19,44%. Ces souches ont été isolées à 73,81% du pus, à 11,90% d’hémoculture, à 4,76% du liquide-céphalorachidien (LCR), et à 2,38% d’urine ainsi que du liquide pleural (LP).Letest de sensibilité aux antibiotiquesréalisé sur 28 souchesanimales et 42 souches hospitalièresde S. aureusa été déterminé par la méthode de diffusion des disques en milieu gélosé. La lecture de l’antibiogrammefaite selon les normes du CA-SFM/EUCAST (2020)a montré que toutes les 28 souches de S. aureusd’origine animale testées sont sensibles au Chloramphénicol et au Cotrimoxazole. Alors que 46,40% des souches sont résistantes à la Pénicilline, 35,70% à la Fosfomycine, 17,90% à la Tobramycine, 14,30% à la Gentamicine et à la Kanamycine, 7,14% à la Lincomycine et à la Norfloxacine, 10,70% à l’Acide fusidique et à la Rifampicine puis 3,60% à la Ciprofloxacine, à la Céfoxitine et à l’Erythromycine. En ce qui concerne lessouches hospitalières, aucune résistance n’a été notée avec le Chloramphénicol, la Lincomycine, l’Ofloxacineet la Rifampicine. Le plus grand nombre de résistancea étéobservé avec la pénicilline G (73,80%). La résistance aux autres antibiotiquesà savoir Oxacilline (14,30%), Céfoxitine (7,10%), Kanamycine (4,80%), Tobramycine (14,30%), Gentamicine (11,90%), Erythromycine (9,50%;), Ciprofloxacine (4,80%), Norfloxacine, Acide fusidique (11,90%), Vancomycine (2,40%) ne dépasse pas 15% à l’exception du Triméthoprime-sulfaméthoxazole (54,80%) et de la Fosfomycine (59,50%). La recherche des gènesde virulencePvlet de résistance MecApar PCR en temps réel a montré que toutes les souches hospitalières (100%) de S. aureusexpriment le gène pvlcontre 84,35% des souches animales; tandisque 12 souches humaines soit 28,57 % et 4des souches animales soit 11,76 %possédaientle gène MecA. PRESIDENT DE JURY : M. Emmanuel BASSENE DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI RAPPORTEUR : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI MEMBRE : Mme Mireille Catherine KADJA WONOU DATE DE SOUTENANCE : 01/07/2022 PAYS : Sénégal Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=5046

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