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Prévalence des souches d’Escherichia coli porteuses géne de virulence associés aux Escherichia coli entérohémorragiques (EHEC) et/ou résistantes aux antibiotiques dans les effluents de la station d’épuration de Cambérène et des abattoirs de Dakar / Mohamed Moustapha Sarr (2012)
Titre : Prévalence des souches d’Escherichia coli porteuses géne de virulence associés aux Escherichia coli entérohémorragiques (EHEC) et/ou résistantes aux antibiotiques dans les effluents de la station d’épuration de Cambérène et des abattoirs de Dakar Type de document : texte imprimé Auteurs : Mohamed Moustapha Sarr, Auteur Editeur : Dakar : EISMV Année de publication : 2012 Importance : 60 p. Note générale :
Langues : Français (fre) Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2012 Mots-clés : ESCHERICHIA COL ANTIBIOTIQUE POLLUTION ALIMENT POUR ANIMAUX ABATTOIR STATION DE CAMBERENE SENEGAL Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : Les E. coli enterohémorragiques (EHEC) sont considérés à l'heure actuelle comme des pathogènes émergents en Santé Publique. Depuis 1982, ils ont souvent été incriminés lors d'épidémies de colites hémorragiques et de Syndromes Hémolytiques et Urémiques (SHU). Les EHEC possèdent un arsenal de facteurs de virulence dont la liste et le rôle exacts restent à déterminer. Les deux protéines majeures impliquées dans leur pouvoir pathogène sont d'une part l'intimine, codée par le gène eae et responsable de lésions intestinales, et d'autre part les Shigatoxines codées par les gènes stx1 ou stx2 et capables de provoquer la mort des cellules intestinales, vasculaires et rénales. Le réservoir principal des EHEC est le tube digestif des bovins. En général, l’homme se contamine à la suite d’ingestion de l’eau ou des aliments contaminés. Dans le but d’évaluer la prévalence et la dissémination des EHEC dans l’environnement, des prélèvements d’effluents ont été réalisés au niveau de la station d’épuration urbaine de Cambérène (STEP) et à l’abattoir de de Dakar. Après le dénombrement des E. coli par pétrifilm sélect E. coli, une collection de 540 souches d’E. coli a été constituée dont 268 souches isolées de l’abattoir, 183 souches de l’effluent brut de la STEP et 89 souches de l’eau clarifiée de la STEP. Un criblage par PCR conventionnelle des gènes de virulence (eae, stx1 et stx2) associés aux EHEC a été effectué sur la collection. Par ailleurs, l’étude de l’antibiorésistance par la méthode de diffusion sur gélose a été réalisée sur 40 souches d’E.coli isolées de l’abattoir et 40 souches isolées à la station d’épuration urbaine. Les résultats du dénombrement d’E. coli (UFC/ml) ont revélé que la charge en E. coli est deux fois plus élevée dans l’effluent de l’abattoir (3.106UFC/ml) que dans l’effluent brut de la STEP (1.5 106UFC/ml). En plus, au niveau du rejet final de la STEP aucune souche d’E. coli n’a été détectée. Parmi les 268 souches d’E. coli isolées de l’abattoir, 4 (1.5%) souches portaient au moins un des gènes eae, stx1 et stx2 dont 2 souches d’E. coli exprimaient le gène eae et 2 souches d’E. coli exprimaient en association les gènes stx1 et stx2. L’étude de l’antibiorésistance montre que la STEP hébergeait un plus grand nombre de souches résistantes. Les 57.5% des souches isolées de la STEP étaient résistantes dont 60.8% à 4 antibiotiques. Le nombre de souches résistantes au niveau de l’abattoir était faible (17.5%) comparé à la STEP. Pour une meilleure gestion du risque lié à la présence de souches d’E.coli potentiellement EHEC dans les effluents d’abattoir de Dakar, il serait souhaitable de mettre en place un système de traitement des effluents d’abattoir avant leur rejet dans le milieu extérieur. Par ailleurs, nous reccomandons une utilisation plus raisonnée des antibiotiques en médecines humaine et animale pour limiter la progression de la résistance de ces bactéries. PRESIDENT DE JURY : M. Moussa Fafa CISSE DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI RAPPORTEUR : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI MEMBRE : M. Malang SEYDI CO-DIRECTEUR : M. Alpha Amadou DIALLO DATE DE SOUTENANCE : 08/12/2012 PAYS : Sénégal Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=1760 Prévalence des souches d’Escherichia coli porteuses géne de virulence associés aux Escherichia coli entérohémorragiques (EHEC) et/ou résistantes aux antibiotiques dans les effluents de la station d’épuration de Cambérène et des abattoirs de Dakar [texte imprimé] / Mohamed Moustapha Sarr, Auteur . - Dakar : EISMV, 2012 . - 60 p.
Langues : Français (fre)
Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2012 Mots-clés : ESCHERICHIA COL ANTIBIOTIQUE POLLUTION ALIMENT POUR ANIMAUX ABATTOIR STATION DE CAMBERENE SENEGAL Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : Les E. coli enterohémorragiques (EHEC) sont considérés à l'heure actuelle comme des pathogènes émergents en Santé Publique. Depuis 1982, ils ont souvent été incriminés lors d'épidémies de colites hémorragiques et de Syndromes Hémolytiques et Urémiques (SHU). Les EHEC possèdent un arsenal de facteurs de virulence dont la liste et le rôle exacts restent à déterminer. Les deux protéines majeures impliquées dans leur pouvoir pathogène sont d'une part l'intimine, codée par le gène eae et responsable de lésions intestinales, et d'autre part les Shigatoxines codées par les gènes stx1 ou stx2 et capables de provoquer la mort des cellules intestinales, vasculaires et rénales. Le réservoir principal des EHEC est le tube digestif des bovins. En général, l’homme se contamine à la suite d’ingestion de l’eau ou des aliments contaminés. Dans le but d’évaluer la prévalence et la dissémination des EHEC dans l’environnement, des prélèvements d’effluents ont été réalisés au niveau de la station d’épuration urbaine de Cambérène (STEP) et à l’abattoir de de Dakar. Après le dénombrement des E. coli par pétrifilm sélect E. coli, une collection de 540 souches d’E. coli a été constituée dont 268 souches isolées de l’abattoir, 183 souches de l’effluent brut de la STEP et 89 souches de l’eau clarifiée de la STEP. Un criblage par PCR conventionnelle des gènes de virulence (eae, stx1 et stx2) associés aux EHEC a été effectué sur la collection. Par ailleurs, l’étude de l’antibiorésistance par la méthode de diffusion sur gélose a été réalisée sur 40 souches d’E.coli isolées de l’abattoir et 40 souches isolées à la station d’épuration urbaine. Les résultats du dénombrement d’E. coli (UFC/ml) ont revélé que la charge en E. coli est deux fois plus élevée dans l’effluent de l’abattoir (3.106UFC/ml) que dans l’effluent brut de la STEP (1.5 106UFC/ml). En plus, au niveau du rejet final de la STEP aucune souche d’E. coli n’a été détectée. Parmi les 268 souches d’E. coli isolées de l’abattoir, 4 (1.5%) souches portaient au moins un des gènes eae, stx1 et stx2 dont 2 souches d’E. coli exprimaient le gène eae et 2 souches d’E. coli exprimaient en association les gènes stx1 et stx2. L’étude de l’antibiorésistance montre que la STEP hébergeait un plus grand nombre de souches résistantes. Les 57.5% des souches isolées de la STEP étaient résistantes dont 60.8% à 4 antibiotiques. Le nombre de souches résistantes au niveau de l’abattoir était faible (17.5%) comparé à la STEP. Pour une meilleure gestion du risque lié à la présence de souches d’E.coli potentiellement EHEC dans les effluents d’abattoir de Dakar, il serait souhaitable de mettre en place un système de traitement des effluents d’abattoir avant leur rejet dans le milieu extérieur. Par ailleurs, nous reccomandons une utilisation plus raisonnée des antibiotiques en médecines humaine et animale pour limiter la progression de la résistance de ces bactéries. PRESIDENT DE JURY : M. Moussa Fafa CISSE DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI RAPPORTEUR : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI MEMBRE : M. Malang SEYDI CO-DIRECTEUR : M. Alpha Amadou DIALLO DATE DE SOUTENANCE : 08/12/2012 PAYS : Sénégal Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=1760 Réservation
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