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Titre : Prévalence des souches de escherichia coli productrices de betalactamases a spectre étendu (BLSE) d’origine animale dans la région de Dakar en 2022 Type de document : texte imprimé Auteurs : Christian Diène Faye, Auteur Editeur : Dakar : EISMV Année de publication : 2023 Importance : 29p. Langues : Français (fre) Catégories : MEMOIRES DE MASTER:2023 Mots-clés : ESCHERICHIA COLI BETALACTAMASES ONE HEALTH Index. décimale : MEM-MEMOIRE MASTER Résumé : L’émergence de microorganismes multirésistants aux antimicrobiens à l’image des entérobactéries productrices de BLSE constitue une véritable préoccupation en santé publique quant à la mise en œuvre de protocoles thérapeutiques appropriés. En effet, les BLSE sont des enzymes qui confèrent aux entérobactéries la résistance à l'ensemble des bétalactamines à l'exception des céphamycines et des carbapénèmes en plus d'une résistance associée à d'autres familles d'antibiotiques. Cette préoccupation a conduit l’OMS, l’OIE et la FAO, en 2015, à proposer un plan de lutte global endossé en 2016 par l’Assemblée Générale des Nations Unies selon une approche « One Health ». La présente étude rentre dans cette optique de collaboration multisectorielle. Elle a pour objectif général de « Connaitre la prévalence des souches de Escherichia coli productrices de BLSE dans les filières avicole et bovine périurbaines de Dakar ».Pour se faire, une collecte de données sur l'usage des antibiotiques dans 51 fermes avicoles et laitières de la zone périurbaine de Dakar a été associée à 314 prélèvements répartis en écouvillons cloacaux, morceaux de caecum, carcasses de poulets et pots de laits frais de vaches. Les analyses ont été effectuées au LNERV. Au total, trente (30) souches de E. coli, ont été isolées des fermes avicoles par la méthode de screening sur gélose de Mac Conkey + Céfotaxime (0,8uL/ml) et confirmées sur galerie API 20E. Par contre, aucune souche n’a été isolée par screening à partir du lait. La sensibilité de ces isolats a été évaluée vis-à-vis de quinze (15) antibiotiques, appartenant à sept (07) familles différentes, selon la méthode de l’antibiogramme standard par diffusion sur gélose Mueller Hinton suivant les recommandations du CA-SFM. La détection de la production des BLSE sur gélose chez les E. coli a été réalisée par le test de synergie BLSE. Toutes les 30 souches étaient résistantes aux différents antibiotiques testés appartenant à la famille des bétalactamines. Des prévalences de résistances assez élevées ont été notées vis-à-vis de certains antibiotiques d’intérêt tels que les quinolones (acide Nalidixique : 86,66% ; ciprofloxacine : 43,33%), l’association Sulfaméthoxazole+Triméthoprime (43,33%), la gentamicine (40%) entre autres. Parmi les trente (30) souches E. coli, seize (16) étaient à phénotype BLSE soit une prévalence de 53,33%. Issues d’une ferme et de deux sites d’abattage de trois communes (Yenne, Sangalkam et Niacourab) du département de Rufisque, elles sont toutes multirésistantes (à plus de 03 familles d’antibiotiques). Au regard de ces résultats obtenus, des perspectives sur le séquençage des E. coli BLSE sont en vue et des recommandations ont déjà été formulées à l’endroit de tous les acteurs des secteurs concernés par cette étude. PRESIDENT DE JURY : M. Yalacé Yamba KABORET DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : M. Alpha Amadou DIALLO MEMBRE : M. Germain Jérôme SAWADOGO/M. Rianatou BADA ALAMBEDJI DATE DE SOUTENANCE : 28/03/2023 PAYS : Sénégal Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=4984 Prévalence des souches de escherichia coli productrices de betalactamases a spectre étendu (BLSE) d’origine animale dans la région de Dakar en 2022 [texte imprimé] / Christian Diène Faye, Auteur . - Dakar : EISMV, 2023 . - 29p.
Langues : Français (fre)
Catégories : MEMOIRES DE MASTER:2023 Mots-clés : ESCHERICHIA COLI BETALACTAMASES ONE HEALTH Index. décimale : MEM-MEMOIRE MASTER Résumé : L’émergence de microorganismes multirésistants aux antimicrobiens à l’image des entérobactéries productrices de BLSE constitue une véritable préoccupation en santé publique quant à la mise en œuvre de protocoles thérapeutiques appropriés. En effet, les BLSE sont des enzymes qui confèrent aux entérobactéries la résistance à l'ensemble des bétalactamines à l'exception des céphamycines et des carbapénèmes en plus d'une résistance associée à d'autres familles d'antibiotiques. Cette préoccupation a conduit l’OMS, l’OIE et la FAO, en 2015, à proposer un plan de lutte global endossé en 2016 par l’Assemblée Générale des Nations Unies selon une approche « One Health ». La présente étude rentre dans cette optique de collaboration multisectorielle. Elle a pour objectif général de « Connaitre la prévalence des souches de Escherichia coli productrices de BLSE dans les filières avicole et bovine périurbaines de Dakar ».Pour se faire, une collecte de données sur l'usage des antibiotiques dans 51 fermes avicoles et laitières de la zone périurbaine de Dakar a été associée à 314 prélèvements répartis en écouvillons cloacaux, morceaux de caecum, carcasses de poulets et pots de laits frais de vaches. Les analyses ont été effectuées au LNERV. Au total, trente (30) souches de E. coli, ont été isolées des fermes avicoles par la méthode de screening sur gélose de Mac Conkey + Céfotaxime (0,8uL/ml) et confirmées sur galerie API 20E. Par contre, aucune souche n’a été isolée par screening à partir du lait. La sensibilité de ces isolats a été évaluée vis-à-vis de quinze (15) antibiotiques, appartenant à sept (07) familles différentes, selon la méthode de l’antibiogramme standard par diffusion sur gélose Mueller Hinton suivant les recommandations du CA-SFM. La détection de la production des BLSE sur gélose chez les E. coli a été réalisée par le test de synergie BLSE. Toutes les 30 souches étaient résistantes aux différents antibiotiques testés appartenant à la famille des bétalactamines. Des prévalences de résistances assez élevées ont été notées vis-à-vis de certains antibiotiques d’intérêt tels que les quinolones (acide Nalidixique : 86,66% ; ciprofloxacine : 43,33%), l’association Sulfaméthoxazole+Triméthoprime (43,33%), la gentamicine (40%) entre autres. Parmi les trente (30) souches E. coli, seize (16) étaient à phénotype BLSE soit une prévalence de 53,33%. Issues d’une ferme et de deux sites d’abattage de trois communes (Yenne, Sangalkam et Niacourab) du département de Rufisque, elles sont toutes multirésistantes (à plus de 03 familles d’antibiotiques). Au regard de ces résultats obtenus, des perspectives sur le séquençage des E. coli BLSE sont en vue et des recommandations ont déjà été formulées à l’endroit de tous les acteurs des secteurs concernés par cette étude. PRESIDENT DE JURY : M. Yalacé Yamba KABORET DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : M. Alpha Amadou DIALLO MEMBRE : M. Germain Jérôme SAWADOGO/M. Rianatou BADA ALAMBEDJI DATE DE SOUTENANCE : 28/03/2023 PAYS : Sénégal Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=4984 Réservation
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Titre : Résistances phenotypiques des souches de escherichia coli en filière avicole dans les régions de Dakar et Thiès Type de document : texte imprimé Auteurs : Christian Diène Faye, Auteur Editeur : Dakar : EISMV Année de publication : 2020 Importance : 108 p. Langues : Français (fre) Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2020 Mots-clés : ESCHERICHIA COLI ANTIBIORESISTANCE ANTIBIOTIQUE COTE D’IVOIRE Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : Au Sénégal, l’incidence des maladies d’origine animale et la transmission de pathogènes via les denrées alimentaires d’origine animale, sont sous-estimées et mal connues. L’émergence de souches d’origine aviaire de Escherichia coli multirésistantes aux antibiotiques transmissibles par contact ou via l’alimentation, constitue un véritable problème de santé publique nécessitant la mise en œuvre d’un système de surveillance au niveau des élevages avicoles. La présente étude a pour objectif de contribuer à la surveillance de la résistance aux antibiotiques afin de réduire l’émergence, le développement et la transmission des bactéries résistantes aux antibiotiques à l’échelon national. Elle a été réalisée dans les régions de Dakar et Thiès à travers des prélèvements d’échantillons et une enquête, effectués sur 65 fermes avicoles et 05 marchés. Au total 65 éleveurs ont été enquêtés avec 532 écouvillons cloacaux et 53 morceaux de peaux de cou collectés.
Le recueil des données d’enquête, faite par interview directe et observation à l’aide des questionnaires d’enquêtes, révèle que les antibiotiques les plus utilisés dans la zone d’étude sont les tétracyclines, les fluoroquinolones et les polypeptidiques. Quarante-neuf (49) sur soixante-cinq (65) éleveurs utilisent les antibiotiques sans prescription vétérinaire. En cas de maladies associées à de fortes mortalités, la totalité (100%) des éleveurs font appel au vétérinaire. L’isolement des souches de Escherichia coli s’est fait sur gélose TBX au niveau du Laboratoire National d’Elevage et de Recherches Vétérinaires. Sur un total de 1083 souches de Escherichia coli isolées, 579 isolats ont été testés vis-à-vis de 14 antibiotiques par la méthode de diffusion sur gélose.
Les résultats ont montré que l’ensemble des souches testées sont résistantes à au moins un antibiotique. Par ailleurs, les résistances les plus élevées ont été observées vis-à-vis de la tétracycline (89,98%), la streptomycine (85,49%), l’association sulfaméthoxazole-triméthoprime (73,05%), l’acide nalidixique (70,46%), la norfloxacine (65,97%) et la kanamycine (62,17%). En revanche, les antibiotiques tels que la céfoxitine, l’ertapénème et la cefotaxime ont manifesté des niveaux de résistance plus bas avec des prévalences respectives de 0,86%, 1,2%, 1,89% et 2,41%.
Par ailleurs, deux souches à phénotype BLSE ont été détectées chez les poules pondeuses et les poulets de chair dans la région de Dakar, F7 et F8. Elles sont multirésistantes à 10 antibiotiques chacune soit respectivement à 4 et 5 familles d’antibiotiques sur six (06) testées. Au regard des résultats obtenus, des recommandations ont été formulées à l’endroit de tous les acteurs des secteurs concernés par cette étude.PRESIDENT DE JURY : Monsieur Djibril FALL DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Madame Rianatou BADA ALAMBEDJI RAPPORTEUR : Madame Rianatou BADA ALAMBEDJI MEMBRE : Madame Bellancille MUSABYEMARIYA CO-DIRECTEUR : Monsieur Alpha Amadou DIALLO DATE DE SOUTENANCE : 10/12/2020 PAYS : Sénégal Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=2733 Résistances phenotypiques des souches de escherichia coli en filière avicole dans les régions de Dakar et Thiès [texte imprimé] / Christian Diène Faye, Auteur . - Dakar : EISMV, 2020 . - 108 p.
Langues : Français (fre)
Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2020 Mots-clés : ESCHERICHIA COLI ANTIBIORESISTANCE ANTIBIOTIQUE COTE D’IVOIRE Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : Au Sénégal, l’incidence des maladies d’origine animale et la transmission de pathogènes via les denrées alimentaires d’origine animale, sont sous-estimées et mal connues. L’émergence de souches d’origine aviaire de Escherichia coli multirésistantes aux antibiotiques transmissibles par contact ou via l’alimentation, constitue un véritable problème de santé publique nécessitant la mise en œuvre d’un système de surveillance au niveau des élevages avicoles. La présente étude a pour objectif de contribuer à la surveillance de la résistance aux antibiotiques afin de réduire l’émergence, le développement et la transmission des bactéries résistantes aux antibiotiques à l’échelon national. Elle a été réalisée dans les régions de Dakar et Thiès à travers des prélèvements d’échantillons et une enquête, effectués sur 65 fermes avicoles et 05 marchés. Au total 65 éleveurs ont été enquêtés avec 532 écouvillons cloacaux et 53 morceaux de peaux de cou collectés.
Le recueil des données d’enquête, faite par interview directe et observation à l’aide des questionnaires d’enquêtes, révèle que les antibiotiques les plus utilisés dans la zone d’étude sont les tétracyclines, les fluoroquinolones et les polypeptidiques. Quarante-neuf (49) sur soixante-cinq (65) éleveurs utilisent les antibiotiques sans prescription vétérinaire. En cas de maladies associées à de fortes mortalités, la totalité (100%) des éleveurs font appel au vétérinaire. L’isolement des souches de Escherichia coli s’est fait sur gélose TBX au niveau du Laboratoire National d’Elevage et de Recherches Vétérinaires. Sur un total de 1083 souches de Escherichia coli isolées, 579 isolats ont été testés vis-à-vis de 14 antibiotiques par la méthode de diffusion sur gélose.
Les résultats ont montré que l’ensemble des souches testées sont résistantes à au moins un antibiotique. Par ailleurs, les résistances les plus élevées ont été observées vis-à-vis de la tétracycline (89,98%), la streptomycine (85,49%), l’association sulfaméthoxazole-triméthoprime (73,05%), l’acide nalidixique (70,46%), la norfloxacine (65,97%) et la kanamycine (62,17%). En revanche, les antibiotiques tels que la céfoxitine, l’ertapénème et la cefotaxime ont manifesté des niveaux de résistance plus bas avec des prévalences respectives de 0,86%, 1,2%, 1,89% et 2,41%.
Par ailleurs, deux souches à phénotype BLSE ont été détectées chez les poules pondeuses et les poulets de chair dans la région de Dakar, F7 et F8. Elles sont multirésistantes à 10 antibiotiques chacune soit respectivement à 4 et 5 familles d’antibiotiques sur six (06) testées. Au regard des résultats obtenus, des recommandations ont été formulées à l’endroit de tous les acteurs des secteurs concernés par cette étude.PRESIDENT DE JURY : Monsieur Djibril FALL DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Madame Rianatou BADA ALAMBEDJI RAPPORTEUR : Madame Rianatou BADA ALAMBEDJI MEMBRE : Madame Bellancille MUSABYEMARIYA CO-DIRECTEUR : Monsieur Alpha Amadou DIALLO DATE DE SOUTENANCE : 10/12/2020 PAYS : Sénégal Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=2733 Réservation
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Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité T1492 TD20-13 Thèse Bibliothèque (SID) Thèses Vétérinaires Disponible Documents numériques
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