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| Titre : |
Caractérisation phénotypique et génétique des Escherichia Coli isolés des cas de colibacilloses aviaires au Sénégal |
| Type de document : |
texte imprimé |
| Auteurs : |
Garba Amina Soumaila, Auteur |
| Editeur : |
Dakar : EISMV |
| Année de publication : |
2012 |
| Importance : |
80 p. |
| Note générale : |
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| Langues : |
Français (fre) |
| Catégories : |
THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2012
|
| Mots-clés : |
ESCHERICHIA COLI COLIBACILLOSE ANTIBIOTIQUE POULET DE CHAIR POULE PONDEUSE POULET SENEGAL |
| Index. décimale : |
TD-THESE DE DOCTORAT |
| Résumé : |
Au Sénégal, l’intensification de l’aviculture s’accompagne de l’émergence de nouvelles pathologies responsables de fortes mortalités, d’énormes pertes économiques et qui constituent également une préoccupation sanitaire majeure. Parmi ces pathologies on note les colibacilloses aviaires dues aux E. coli qui présentent de plus en plus des fréquences de résistance aux antibactériens très élevées avec une tendance nette à la multirésistance. La présente étude a été menée dans le but de faire une caractérisation phénotypique et génétique des E. coli isolés des cas de colibacilloses au Sénégal. C’est ainsi que les principaux sérotypes, gènes de virulence pour les APEC et les STEC, ainsi que les virotypes de 58 échantillons d’E. coli ont été recherchés par PCR multiplexe et leur résistance vis-à-vis de 15 antibiotiques testée par la méthode de diffusion sur gélose Mueller-Hinton. Les résultats de la PCR présentent les gènes iucD (53%) et tsh (29%) comme étant les gènes de virulence largement diffusés dans les souches E. coli, les virotypes largement diffusés étant iucDtsh (26%) et iucD (17%). Parmi les sérotypes recherchés, le sérotype O25 (12%) a été le plus prévalent alors que les sérotypes O2 et O78 ont été obtenus dans 2% des cas. Sur les 58 isolats testés, un seul isolat a présenté les gènes eae et stx1 des STEC. Le séro-virotype O25-iucD-tsh (10%) s’est également révélé comme étant le plus prévalent. Les résultats de l’antibiogramme ont présenté les niveaux de résistance les plus élevés pour la tétracycline (95%), le sulfisoxazole (90%), l’ampicilline (78%), la streptomycine (71%), l’association trimétroprime sulfaméthoxazole (65%) et l’acide nalidixique (48%).Une résistance de 22% a été notée pour le chloramphénicol et 14% pour la ciprofloxacine. En revanche, les antibiotiques tels que la kanamycine, la gentamicine et le ceftiofur ont montré des niveaux de résistance les plus bas avec respectivement 7%, 5% et 3%. Toutefois, aucune résistance n’a été observée pour quatre antibiotiques à savoir l’amoxicilline, le ceftriaxone, l’amikacine et la cefoxitine. L’antibiogramme a également révélé une importante multirésistance. En effet, 88% des
isolats étaient résistants à au moins quatre (4) antibiotiques et un (1) isolat présentait une résistance à neuf (9) antibiotiques. |
| PRESIDENT DE JURY : |
M. Bernard Marcel DIOP |
| DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : |
Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI |
| RAPPORTEUR : |
Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI |
| MEMBRE : |
M. Germain Jérôme SAWADOGO |
| CO-DIRECTEUR : |
M. Yaghouba KANE |
| DATE DE SOUTENANCE : |
22/02/2012 |
| PAYS : |
NIGER |
| Permalink : |
./index.php?lvl=notice_display&id=1720 |
Caractérisation phénotypique et génétique des Escherichia Coli isolés des cas de colibacilloses aviaires au Sénégal [texte imprimé] / Garba Amina Soumaila, Auteur . - Dakar : EISMV, 2012 . - 80 p.
Langues : Français ( fre)
| Catégories : |
THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2012
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| Mots-clés : |
ESCHERICHIA COLI COLIBACILLOSE ANTIBIOTIQUE POULET DE CHAIR POULE PONDEUSE POULET SENEGAL |
| Index. décimale : |
TD-THESE DE DOCTORAT |
| Résumé : |
Au Sénégal, l’intensification de l’aviculture s’accompagne de l’émergence de nouvelles pathologies responsables de fortes mortalités, d’énormes pertes économiques et qui constituent également une préoccupation sanitaire majeure. Parmi ces pathologies on note les colibacilloses aviaires dues aux E. coli qui présentent de plus en plus des fréquences de résistance aux antibactériens très élevées avec une tendance nette à la multirésistance. La présente étude a été menée dans le but de faire une caractérisation phénotypique et génétique des E. coli isolés des cas de colibacilloses au Sénégal. C’est ainsi que les principaux sérotypes, gènes de virulence pour les APEC et les STEC, ainsi que les virotypes de 58 échantillons d’E. coli ont été recherchés par PCR multiplexe et leur résistance vis-à-vis de 15 antibiotiques testée par la méthode de diffusion sur gélose Mueller-Hinton. Les résultats de la PCR présentent les gènes iucD (53%) et tsh (29%) comme étant les gènes de virulence largement diffusés dans les souches E. coli, les virotypes largement diffusés étant iucDtsh (26%) et iucD (17%). Parmi les sérotypes recherchés, le sérotype O25 (12%) a été le plus prévalent alors que les sérotypes O2 et O78 ont été obtenus dans 2% des cas. Sur les 58 isolats testés, un seul isolat a présenté les gènes eae et stx1 des STEC. Le séro-virotype O25-iucD-tsh (10%) s’est également révélé comme étant le plus prévalent. Les résultats de l’antibiogramme ont présenté les niveaux de résistance les plus élevés pour la tétracycline (95%), le sulfisoxazole (90%), l’ampicilline (78%), la streptomycine (71%), l’association trimétroprime sulfaméthoxazole (65%) et l’acide nalidixique (48%).Une résistance de 22% a été notée pour le chloramphénicol et 14% pour la ciprofloxacine. En revanche, les antibiotiques tels que la kanamycine, la gentamicine et le ceftiofur ont montré des niveaux de résistance les plus bas avec respectivement 7%, 5% et 3%. Toutefois, aucune résistance n’a été observée pour quatre antibiotiques à savoir l’amoxicilline, le ceftriaxone, l’amikacine et la cefoxitine. L’antibiogramme a également révélé une importante multirésistance. En effet, 88% des
isolats étaient résistants à au moins quatre (4) antibiotiques et un (1) isolat présentait une résistance à neuf (9) antibiotiques. |
| PRESIDENT DE JURY : |
M. Bernard Marcel DIOP |
| DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : |
Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI |
| RAPPORTEUR : |
Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI |
| MEMBRE : |
M. Germain Jérôme SAWADOGO |
| CO-DIRECTEUR : |
M. Yaghouba KANE |
| DATE DE SOUTENANCE : |
22/02/2012 |
| PAYS : |
NIGER |
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./index.php?lvl=notice_display&id=1720 |
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