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Résistances phénotypique et génotypique des escherichia coli isolés des élevages de volailles dans la région des plateaux au sud Togo en 2021 / Hamey Soumana HAMZA (2022)
Titre : Résistances phénotypique et génotypique des escherichia coli isolés des élevages de volailles dans la région des plateaux au sud Togo en 2021 Type de document : texte imprimé Auteurs : Hamey Soumana HAMZA, Auteur Editeur : Dakar : EISMV Année de publication : 2022 Importance : 97 p. Langues : Français (fre) Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2022 Mots-clés : ANTIBIOTIQUE ANTIBIORESISTANCE PHENOTYPIQUE GENOTYPIQUE ESCHERICHIA COLI AVICULTURE VOLAILLE TOGO Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : Cette étude a été menée afin de réaliser une caractérisation phénotypique et génotypique des entérobactéries isolées des élevages avicoles dans la région des plateaux au sud Togo. Elle a été conduite en deux phases. La première phase était consacrée à la collecte des données sur le terrain et la seconde phase était consacrée à l’identification des souches bactériennes ; à l’antibiogramme et à la PCR. Ainsi, au total, 51 éleveurs parmi lesquels 44 hommes et 07 femmes ont été enquêtés, les résultats de l’enquête ont révélé que 88,23% des éleveurs ont une connaissance sur la notion d’antibiotique et 94,11% les utilisaient. Cinquante-huit (58) échantillons de matières fécales issus de 51 fermes avicoles ont été collectés et analysés. Un total de 51 souches d’Escherichia coli ont été isolées avec un taux d’isolement de 32,75%. La méthode de l’antibiogramme par diffusion sur gélose a été utilisée pour tester la sensibilité des bactéries isolées par rapport à 14 antibiotiques d’importance en médecines humaine et vétérinaire.
L’antibiogramme sur les souches de E. colia montré une résistance variable à tous les14 antibiotiques testés. Les prévalences de la résistance aux antibiotiques les plus élevées ont été observées avec la tétracycline (96%), les sulfamides (90%), le sulfamethoxazole-triméthoprime (90%), la Streptomycine (73%) l’ampicilline (65%), la ticarcilline (65%) la cefoxitine (57%), les prévalences moyennes concernaient l’amoxicilline+acide clavulanique (31%), la cefuroxime (27%), l’acide nalixidique (25%), la gentamycine (16%). La ceftazidine, la ciprofloxacine et la ceftriaxone ont montré des niveaux de résistance plus bas avec des taux respectifs de, 8%, 8% et 4%.
Au sujet de la multirésistance, 76,47% des isolats avait une multirésistance dont 56,41% étaient résistants à 3-4 antibiotiques 35,89% résistants à 5-6 antibiotiques et 7,69% résistants à 7-8 antibiotiques.
Par rapport aux gènes de résistance, les résultats obtenus ont montré des prévalences de : 74,19% pour le gène blaTEM ; 69,23%pour le gène blaCTX-M15 ; 92,11% pour le gène tetA et 68,42% pour le gène sul1.
Ces résultats sont en accord avec les données recueillies de l’enquête qui montrent que 67,74% des fermes, soit 94,11% des fermes avicoles, utilisent les antibiotiques majoritairement en prophylaxie. Les antibiotiques les plus utilisés sont les tétracyclines, les macrolides et les aminosides avec les pourcentages de 90,19%, 78,43% et 76,47%.
Les différentes fréquences de résistance observées dans cette étude suggèrent qu’il y a une relation entre l’utilisation abusive de certains antibiotiques par l’automédication couramment pratiquée en élevage au Togo et l’émergence de germes résistants.PRESIDENT DE JURY : M. Mounibé DIARRA DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI RAPPORTEUR : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI MEMBRE : Mme Mireille Catherine KADJA WONOU DATE DE SOUTENANCE : 10/06/2022 PAYS : Niger Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=5041 Résistances phénotypique et génotypique des escherichia coli isolés des élevages de volailles dans la région des plateaux au sud Togo en 2021 [texte imprimé] / Hamey Soumana HAMZA, Auteur . - Dakar : EISMV, 2022 . - 97 p.
Langues : Français (fre)
Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2022 Mots-clés : ANTIBIOTIQUE ANTIBIORESISTANCE PHENOTYPIQUE GENOTYPIQUE ESCHERICHIA COLI AVICULTURE VOLAILLE TOGO Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : Cette étude a été menée afin de réaliser une caractérisation phénotypique et génotypique des entérobactéries isolées des élevages avicoles dans la région des plateaux au sud Togo. Elle a été conduite en deux phases. La première phase était consacrée à la collecte des données sur le terrain et la seconde phase était consacrée à l’identification des souches bactériennes ; à l’antibiogramme et à la PCR. Ainsi, au total, 51 éleveurs parmi lesquels 44 hommes et 07 femmes ont été enquêtés, les résultats de l’enquête ont révélé que 88,23% des éleveurs ont une connaissance sur la notion d’antibiotique et 94,11% les utilisaient. Cinquante-huit (58) échantillons de matières fécales issus de 51 fermes avicoles ont été collectés et analysés. Un total de 51 souches d’Escherichia coli ont été isolées avec un taux d’isolement de 32,75%. La méthode de l’antibiogramme par diffusion sur gélose a été utilisée pour tester la sensibilité des bactéries isolées par rapport à 14 antibiotiques d’importance en médecines humaine et vétérinaire.
L’antibiogramme sur les souches de E. colia montré une résistance variable à tous les14 antibiotiques testés. Les prévalences de la résistance aux antibiotiques les plus élevées ont été observées avec la tétracycline (96%), les sulfamides (90%), le sulfamethoxazole-triméthoprime (90%), la Streptomycine (73%) l’ampicilline (65%), la ticarcilline (65%) la cefoxitine (57%), les prévalences moyennes concernaient l’amoxicilline+acide clavulanique (31%), la cefuroxime (27%), l’acide nalixidique (25%), la gentamycine (16%). La ceftazidine, la ciprofloxacine et la ceftriaxone ont montré des niveaux de résistance plus bas avec des taux respectifs de, 8%, 8% et 4%.
Au sujet de la multirésistance, 76,47% des isolats avait une multirésistance dont 56,41% étaient résistants à 3-4 antibiotiques 35,89% résistants à 5-6 antibiotiques et 7,69% résistants à 7-8 antibiotiques.
Par rapport aux gènes de résistance, les résultats obtenus ont montré des prévalences de : 74,19% pour le gène blaTEM ; 69,23%pour le gène blaCTX-M15 ; 92,11% pour le gène tetA et 68,42% pour le gène sul1.
Ces résultats sont en accord avec les données recueillies de l’enquête qui montrent que 67,74% des fermes, soit 94,11% des fermes avicoles, utilisent les antibiotiques majoritairement en prophylaxie. Les antibiotiques les plus utilisés sont les tétracyclines, les macrolides et les aminosides avec les pourcentages de 90,19%, 78,43% et 76,47%.
Les différentes fréquences de résistance observées dans cette étude suggèrent qu’il y a une relation entre l’utilisation abusive de certains antibiotiques par l’automédication couramment pratiquée en élevage au Togo et l’émergence de germes résistants.PRESIDENT DE JURY : M. Mounibé DIARRA DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI RAPPORTEUR : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI MEMBRE : Mme Mireille Catherine KADJA WONOU DATE DE SOUTENANCE : 10/06/2022 PAYS : Niger Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=5041 Réservation
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