Titre :	Prévalence des gènes de virulence et d’antibiorésistance des Escherichia coli dans les fermes de poulet de chair de la zone péri-urbaine de Dakar (Sénégal)
Type de document :	texte imprimé
Auteurs :	Passoret Vounba, Auteur
Editeur :	Dakar : EISMV
Année de publication :	2012
Importance :	30 p.
Note générale :
Langues :	Français (fre)
Catégories :	MEMOIRES DE MASTER:2012
Mots-clés :	ESCHERICHIA COLI  POULET  POULET DE CHAIR  ANTIBIOTIQUE  ANTIBIORESISTANCE  SENEGAL
Index. décimale :	MEM-MEMOIRE MASTER
Résumé :	Cette étude pionnière avait pour objectif de caractériser les souches d’Escherichia coli isolées des échantillons collectés dans 32 fermes de poulets de chair de la zone périurbaine de Dakar. Un total de 118 échantillons a ainsi été criblé par PCR multiplexes pour la détermination de la prévalence des gènes de virulence des ExPEC et des STEC. Les résultats ont montré une prévalence significativement élevée des gènes de virulence des ExPEC (iucD : 62% ; tsh : 50% ; papC : 33% et cnf : 6,8%) comparativement à la prévalence des gènes de virulence des STEC (eae : 3% ; stx1 : 3,4% et stx2 : 0%). A partir de ces 118 souches, 173 isolats ont été sélectionnés après des tests biochimiques et soumis au test de sensibilité à 15 antibiotiques, en utilisant la méthode de diffusion en gélose. La résistance a intéressé tous les 15 antibiotiques et les plus hauts niveaux de résistance ont été enregistrés pour la tétracycline (94%), le sulfisoxazole (90%) et le triméthoprime-sulfaméthoxazole (85%). Parmi ces 173 isolats, 90 ont été testés par PCR multiplexe pour la recherche des virotypes des ExPEC. Ce test a montré une forte prévalence des virotypes impliquant uniquement les gènes iucD et/ou tsh (iucD-tsh (14,44%), iucD (7,77%) et tsh (7,77%)) par rapport aux autres virotypes (tsh-papC (1,11%) et tsh-cnf (1,11%)). En fin, 25 isolats choisis parmi les 90 précédents ont été testés par PCR uniplexes pour la détection des gènes de résistance à l’ampicilline (blaTEM, blaSHV, blaOXA), aux quinolones (qnrA, qnrB, qnrS, aac(6)), au ceftriaxone (blaCTX-M15) et au ceftiofur (blaCMY-2). Une forte prévalence a été obtenue pour le gène blaTEM (72%) avec une association significative à la résistance phénotypique, suivie de la prévalence des gènes qnrB (24%) et blaSHV (12%). Aucun isolat n’était positif aux gènes blaOXA, qnrA, aac(6) et blaCMY-2. Cette étude préliminaire mérite d’être complétée par une caractérisation phylogénique et génotypique afin de connaître les groupes phylogénétiques d’Escherichia coli présents au Sénégal
PRESIDENT DE JURY :	M. PANGUI Louis Joseph, Pr à l’EISMV de Dakar
DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE :	Mme BADA ALAMBEDJI Rianatou, Pr à l’EISMV de Dakar
MEMBRE :	M. TOGUEBAYE Bhen Sikina, Pr à la FST de l’UCAD/M. SAWADOGO Germain Jérôme, Pr à l’EISMV de Dakar
CO-DIRECTEUR :	M. FAIRBROTHER John Morris, Pr à l’Université de Montréal et directeur du EcL /M. KONE Philippe Soumahoro, Assistant au service de MIPI (E.I.S.M.V de Dakar)
DATE DE SOUTENANCE :	28/01/2012
PAYS :	TCHAD
Permalink :	./index.php?lvl=notice_display&id=723

Prévalence des gènes de virulence et d’antibiorésistance des Escherichia coli dans les fermes de poulet de chair de la zone péri-urbaine de Dakar (Sénégal) [texte imprimé] / Passoret Vounba, Auteur . - Dakar : EISMV, 2012 . - 30 p.


Langues : Français (fre)

Catégories :	MEMOIRES DE MASTER:2012
Mots-clés :	ESCHERICHIA COLI  POULET  POULET DE CHAIR  ANTIBIOTIQUE  ANTIBIORESISTANCE  SENEGAL
Index. décimale :	MEM-MEMOIRE MASTER
Résumé :	Cette étude pionnière avait pour objectif de caractériser les souches d’Escherichia coli isolées des échantillons collectés dans 32 fermes de poulets de chair de la zone périurbaine de Dakar. Un total de 118 échantillons a ainsi été criblé par PCR multiplexes pour la détermination de la prévalence des gènes de virulence des ExPEC et des STEC. Les résultats ont montré une prévalence significativement élevée des gènes de virulence des ExPEC (iucD : 62% ; tsh : 50% ; papC : 33% et cnf : 6,8%) comparativement à la prévalence des gènes de virulence des STEC (eae : 3% ; stx1 : 3,4% et stx2 : 0%). A partir de ces 118 souches, 173 isolats ont été sélectionnés après des tests biochimiques et soumis au test de sensibilité à 15 antibiotiques, en utilisant la méthode de diffusion en gélose. La résistance a intéressé tous les 15 antibiotiques et les plus hauts niveaux de résistance ont été enregistrés pour la tétracycline (94%), le sulfisoxazole (90%) et le triméthoprime-sulfaméthoxazole (85%). Parmi ces 173 isolats, 90 ont été testés par PCR multiplexe pour la recherche des virotypes des ExPEC. Ce test a montré une forte prévalence des virotypes impliquant uniquement les gènes iucD et/ou tsh (iucD-tsh (14,44%), iucD (7,77%) et tsh (7,77%)) par rapport aux autres virotypes (tsh-papC (1,11%) et tsh-cnf (1,11%)). En fin, 25 isolats choisis parmi les 90 précédents ont été testés par PCR uniplexes pour la détection des gènes de résistance à l’ampicilline (blaTEM, blaSHV, blaOXA), aux quinolones (qnrA, qnrB, qnrS, aac(6)), au ceftriaxone (blaCTX-M15) et au ceftiofur (blaCMY-2). Une forte prévalence a été obtenue pour le gène blaTEM (72%) avec une association significative à la résistance phénotypique, suivie de la prévalence des gènes qnrB (24%) et blaSHV (12%). Aucun isolat n’était positif aux gènes blaOXA, qnrA, aac(6) et blaCMY-2. Cette étude préliminaire mérite d’être complétée par une caractérisation phylogénique et génotypique afin de connaître les groupes phylogénétiques d’Escherichia coli présents au Sénégal
PRESIDENT DE JURY :	M. PANGUI Louis Joseph, Pr à l’EISMV de Dakar
DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE :	Mme BADA ALAMBEDJI Rianatou, Pr à l’EISMV de Dakar
MEMBRE :	M. TOGUEBAYE Bhen Sikina, Pr à la FST de l’UCAD/M. SAWADOGO Germain Jérôme, Pr à l’EISMV de Dakar
CO-DIRECTEUR :	M. FAIRBROTHER John Morris, Pr à l’Université de Montréal et directeur du EcL /M. KONE Philippe Soumahoro, Assistant au service de MIPI (E.I.S.M.V de Dakar)
DATE DE SOUTENANCE :	28/01/2012
PAYS :	TCHAD
Permalink :	./index.php?lvl=notice_display&id=723