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Evaluation des pratiques avicoles et de l’antibio- résistance des salmonelles isolées chez les poules pondeuses en zone périurbaine de Bamako (Mali) / Amadou dit baba Traoré (2016) 

Public ISBD Titre : Evaluation des pratiques avicoles et de l’antibio- résistance des salmonelles isolées chez les poules pondeuses en zone périurbaine de Bamako (Mali) Type de document : texte imprimé Auteurs : Amadou dit baba Traoré, Auteur Editeur : Dakar : EISMV Année de publication : 2016 Importance : 76 p. Note générale : Langues : Français (fre) Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2016 Mots-clés : ANTIBIORESITANCE  POULET  POULE PONDEUSE  SALMONELLA  ANTIBIOTIQUE  MALI Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : Au cours de ces dernières années, l’aviculture moderne a connu un essor considérable dans plusieurs zones périurbaines du Mali. Face aux pathologies, l’utilisation abusive d’antibiotiques en chimioprévention au détriment de l’immunisation constitue aujourd’hui un véritable problème de santé publique. La présente étude consistait à faire l’état des lieux des pratiques avicoles et de la résistance des salmonelles aux antibiotiques dans les élevages semi-intensifs chez les poules pondeuses en zone périurbaine de Bamako. Pour atteindre cet objectif, les travaux se sont déroulés au cours de la période allant de Septembre 2014 à Mai 2015. Ainsi, 46 exploitations avicoles des poules pondeuses ont été enquêtées sur les six (06) axes principaux du District qui sont : Bamako – Koulikoro, Bamako - Siby, Bamako – Kangaba, Bamako – Ségou, Bamako – Kati, BamakoBougouni. Au cours des prélèvements, 169 échantillons (écouvillons et organes) ont été collectés dans 46 fermes et analysés, suite à des suspicions. Sur les 46 exploitations avicoles enquêtées, L’analyse ou l’évaluation des mesures de biosécurité montrait que la durée du vide sanitaire est respectée dans toutes les exploitations ; 52,17% ne respectaient pas la distance conventionnelle entre deux exploitations avicoles. Seulement 15,22% des fermes possédaient une clôture et 84,78% étaient alors accessibles aux oiseaux sauvages. La plupart des fermes enquêtées possédaient le système de la bande unique, soit 65,21%, un petit nombre (10,87%) respectait les normes de construction. Dans les fermes enquêtées, aucune ne possèdent des bacs de désinfection à l’entrée des exploitations et 13,04% des bacs de désinfection à l’entrée des poulaillers. L’analyse du système d’abreuvement montrait que l’eau utilisée pour abreuver les poulets est la même que celle utilisée pour administrer les antibiotiques. Cette eau provenait des puits (50%) ou des forages (50%). Les cadavres issus des élevages étaient rejetés dans la nature dans 52,17% des fermes, destinés à la consommation humaine dans 8,69%, enfouis dans 8,69% et incinérés dans 6,52%. Les programmes de prophylaxie appliqués dans les fermes étaient fournis par les fournisseurs de poussins dans 30,43%. Notons que ces programmes de prophylaxie sont appliqués dans 93,48% des fermes enquêtées. Ces programmes de prophylaxie étaient différents d’un fournisseur à un autre. En ce qui concerne les agents de santé animale enquêtés, seulement cinq sur 46 (soit 8,69%) n’ont pas reçu une formation diplômante ou qualifiante vétérinaire, cinq (soit 10,46%) ont un grade de docteur vétérinaire ; 12 (26,09%) sont des ingénieurs zootechniciens ; 28 (60,87%) représentent des techniciens d’élevages et un (2,17%) technicien supérieur d’élevage. Les pathologies les plus fréquemment rencontrées dans la zone de l’étude sont : la salmonellose, les affections respiratoires (Coryza), la maladie de Mareck et la combinaison de ces maladies. Selon les agents de santé animale, les échecs thérapeutiques sont dus à un mauvais diagnostic pour 39,13%, selon 28,26% à une mauvaise application des consignes d’administration des antibiotiques prescrits à l’éleveur, 15,22% à la qualité des médicaments utilisés et 15,22% au développement de résistance. Au total, 15,22% des agents de santé animale enquêtés affirment avoir des notions concernant les résidus d’antibiotiques. Ces agents de santé confirment que l’usage des antibiotiques en aviculture représente un risque pour la santé publique et qu’aucune restriction n’a été imposée sur la gamme d’antibiotiques à utiliser dans les fermes au Mali. Les résultats issus de ce travail ont montré que 23 fermes (soit 50% des élevages) sont contaminées. A partir des 169 échantillons prélevés, il a été obtenu 25 isolats de salmonelles (14,79%). Les pourcentages de résistance ont été obtenus avec l’érythromycine (85,58%), la Streptomycine (81,13%), la Doxycycline (76,13%), la colistine (68,20%), la tétracycline (67,5%), la Kanamycine (62,84%), la fluméquine (50,84%) et la gentamycine (7,34%). Seuls quatre sur 25 isolats (16%) ont été résistants à un seul antibiotique alors que 21 sur 25 (84%) l’étaient pour deux antibiotiques ou plus. PRESIDENT DE JURY : M. Bernard Marcel DIOP DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI RAPPORTEUR : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI MEMBRE : M. Alain Richi KAMGA WALADJO CO-DIRECTEUR : M. Satigui SIDIBE DATE DE SOUTENANCE : 30/04/2016 PAYS : Mali Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=1910 Evaluation des pratiques avicoles et de l’antibio- résistance des salmonelles isolées chez les poules pondeuses en zone périurbaine de Bamako (Mali) [texte imprimé] / Amadou dit baba Traoré, Auteur . - Dakar : EISMV, 2016 . - 76 p. Langues : Français (fre) Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2016 Mots-clés : ANTIBIORESITANCE  POULET  POULE PONDEUSE  SALMONELLA  ANTIBIOTIQUE  MALI Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : Au cours de ces dernières années, l’aviculture moderne a connu un essor considérable dans plusieurs zones périurbaines du Mali. Face aux pathologies, l’utilisation abusive d’antibiotiques en chimioprévention au détriment de l’immunisation constitue aujourd’hui un véritable problème de santé publique. La présente étude consistait à faire l’état des lieux des pratiques avicoles et de la résistance des salmonelles aux antibiotiques dans les élevages semi-intensifs chez les poules pondeuses en zone périurbaine de Bamako. Pour atteindre cet objectif, les travaux se sont déroulés au cours de la période allant de Septembre 2014 à Mai 2015. Ainsi, 46 exploitations avicoles des poules pondeuses ont été enquêtées sur les six (06) axes principaux du District qui sont : Bamako – Koulikoro, Bamako - Siby, Bamako – Kangaba, Bamako – Ségou, Bamako – Kati, BamakoBougouni. Au cours des prélèvements, 169 échantillons (écouvillons et organes) ont été collectés dans 46 fermes et analysés, suite à des suspicions. Sur les 46 exploitations avicoles enquêtées, L’analyse ou l’évaluation des mesures de biosécurité montrait que la durée du vide sanitaire est respectée dans toutes les exploitations ; 52,17% ne respectaient pas la distance conventionnelle entre deux exploitations avicoles. Seulement 15,22% des fermes possédaient une clôture et 84,78% étaient alors accessibles aux oiseaux sauvages. La plupart des fermes enquêtées possédaient le système de la bande unique, soit 65,21%, un petit nombre (10,87%) respectait les normes de construction. Dans les fermes enquêtées, aucune ne possèdent des bacs de désinfection à l’entrée des exploitations et 13,04% des bacs de désinfection à l’entrée des poulaillers. L’analyse du système d’abreuvement montrait que l’eau utilisée pour abreuver les poulets est la même que celle utilisée pour administrer les antibiotiques. Cette eau provenait des puits (50%) ou des forages (50%). Les cadavres issus des élevages étaient rejetés dans la nature dans 52,17% des fermes, destinés à la consommation humaine dans 8,69%, enfouis dans 8,69% et incinérés dans 6,52%. Les programmes de prophylaxie appliqués dans les fermes étaient fournis par les fournisseurs de poussins dans 30,43%. Notons que ces programmes de prophylaxie sont appliqués dans 93,48% des fermes enquêtées. Ces programmes de prophylaxie étaient différents d’un fournisseur à un autre. En ce qui concerne les agents de santé animale enquêtés, seulement cinq sur 46 (soit 8,69%) n’ont pas reçu une formation diplômante ou qualifiante vétérinaire, cinq (soit 10,46%) ont un grade de docteur vétérinaire ; 12 (26,09%) sont des ingénieurs zootechniciens ; 28 (60,87%) représentent des techniciens d’élevages et un (2,17%) technicien supérieur d’élevage. Les pathologies les plus fréquemment rencontrées dans la zone de l’étude sont : la salmonellose, les affections respiratoires (Coryza), la maladie de Mareck et la combinaison de ces maladies. Selon les agents de santé animale, les échecs thérapeutiques sont dus à un mauvais diagnostic pour 39,13%, selon 28,26% à une mauvaise application des consignes d’administration des antibiotiques prescrits à l’éleveur, 15,22% à la qualité des médicaments utilisés et 15,22% au développement de résistance. Au total, 15,22% des agents de santé animale enquêtés affirment avoir des notions concernant les résidus d’antibiotiques. Ces agents de santé confirment que l’usage des antibiotiques en aviculture représente un risque pour la santé publique et qu’aucune restriction n’a été imposée sur la gamme d’antibiotiques à utiliser dans les fermes au Mali. Les résultats issus de ce travail ont montré que 23 fermes (soit 50% des élevages) sont contaminées. A partir des 169 échantillons prélevés, il a été obtenu 25 isolats de salmonelles (14,79%). Les pourcentages de résistance ont été obtenus avec l’érythromycine (85,58%), la Streptomycine (81,13%), la Doxycycline (76,13%), la colistine (68,20%), la tétracycline (67,5%), la Kanamycine (62,84%), la fluméquine (50,84%) et la gentamycine (7,34%). Seuls quatre sur 25 isolats (16%) ont été résistants à un seul antibiotique alors que 21 sur 25 (84%) l’étaient pour deux antibiotiques ou plus. PRESIDENT DE JURY : M. Bernard Marcel DIOP DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI RAPPORTEUR : Mme Rianatou BADA ALAMBEDJI MEMBRE : M. Alain Richi KAMGA WALADJO CO-DIRECTEUR : M. Satigui SIDIBE DATE DE SOUTENANCE : 30/04/2016 PAYS : Mali Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=1910

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Portage d'escherichia coli par les carcasses de bovines préparées aux abattoirs de Dakar et évaluation du profil de l'antibiorésistance associée / Thierno Niang (2021) 

Public ISBD Titre : Portage d'escherichia coli par les carcasses de bovines préparées aux abattoirs de Dakar et évaluation du profil de l'antibiorésistance associée Type de document : texte imprimé Auteurs : Thierno Niang, Auteur Editeur : Dakar : EISMV Année de publication : 2021 Importance : 81 p. Langues : Français (fre) Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2021 Mots-clés : ESCHERICHIA COLI  ANTIBIORESITANCE  ANTIBIOTIQUE  ABATTOIR  SÉNÉGAL Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : Ce travail qui porte sur le « portage d’Escherichia coli par les carcasses bovines préparées aux abattoirs de Dakar et évaluation du profil de l’antibiorésistance associée », vise à évaluer le niveau de contamination par E. coli des carcasses bovines des abattoirs de Dakar et de caractériser l’antibiorésistance associée aux souches d’E.coli isolées. Cette étude s’est déroulée dans la période de mars à septembre 2020. Notre se décompose en 3 parties : enquêtes de terrain, en analyses microbiologiques et caractérisation de la résistance phénotypique aux antibiotiques des souches d’E. coli isolées. Les enquêtes ont révélées d’énormes insuffisances et défaillances sur l’hygiène de la préparation. Les résultats des analyses bactériologiques, sur 120 échantillons prélevés sur 120 carcasses bovines, ont permis d’avoir une idée sur le niveau de contamination superficielle des carcasses par E. coli au cours de leur préparation. Les résultats obtenus révèlent : - une prévalence de 99,17 % de portage d’E. coli par les carcasses échantillonnées ; - une moyenne de portage d’E. coli par ces carcasses de 3,01 log10 UFC/cm² +/- 0,80 ; - que l’échantillon le plus contaminé a un niveau de contamination supérieur à 5,18 log10 UFC/cm², la moins contaminée avec une contamination de 1 log10 UFC/cm². L’analyse des résultats a montré que le jeudi représente le jour on note les plus fortes charges bactériennes au niveau des carcasses. Cette contamination non négligeable des carcasses par ces germes, serait fortement liée aux méthodes de travail et secondairement à l’environnement du circuit de la préparation des bovins. L’analyse de l’antibiorésistance de 57 souches d’E. coli a montré une résistance de 32% à la tétracycline, de 26% à la colistine, de 12% à la céfépime et à la céfoxitine, de 11% à l’ampicilline, la gentamicine et l’amoxicilline +acide clavulanique, 9% à la kanamycine et la céftazidime, de 5% à la ciprofloxacine, de 4% à la céfalotine et de 2% à l’acide nalidixique. En revanche, aucune souche n’est résistante à la céfotaxime, l’imipénème et à la norfloxacine. Près de 15,80% de ces souches soumises à l’antibiogramme, sont qualifiées de multirésistantes, soit 9/57. Près de 42,10% d’entre-elles sont résistantes à deux classes d’antibiotiques, 36,84% résistantes à une classe et les 5,26% autres restants, sont sensibles à toutes les classes d’antibiotiques utilisés. Compte tenu de ces résultats, il devient indispensable d’améliorer les conditions et méthodes de travail sur toute la chaîne de production mais aussi de rationaliser l’utilisation des antibiotiques aussi bien en médecine humaine qu’animale. PRESIDENT DE JURY : Monsieur Djibril FALL DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Madame Bellancille MUSABYEMARIYA RAPPORTEUR : Madame Bellancille MUSABYEMARIYA MEMBRE : Monsieur Oubri Bassa GBATI CO-DIRECTEUR : Monsieur Luc LOUBAMBA DATE DE SOUTENANCE : 21/04/2021 PAYS : Sénégal Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=4700 Portage d'escherichia coli par les carcasses de bovines préparées aux abattoirs de Dakar et évaluation du profil de l'antibiorésistance associée [texte imprimé] / Thierno Niang, Auteur . - Dakar : EISMV, 2021 . - 81 p. Langues : Français (fre) Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2021 Mots-clés : ESCHERICHIA COLI  ANTIBIORESITANCE  ANTIBIOTIQUE  ABATTOIR  SÉNÉGAL Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : Ce travail qui porte sur le « portage d’Escherichia coli par les carcasses bovines préparées aux abattoirs de Dakar et évaluation du profil de l’antibiorésistance associée », vise à évaluer le niveau de contamination par E. coli des carcasses bovines des abattoirs de Dakar et de caractériser l’antibiorésistance associée aux souches d’E.coli isolées. Cette étude s’est déroulée dans la période de mars à septembre 2020. Notre se décompose en 3 parties : enquêtes de terrain, en analyses microbiologiques et caractérisation de la résistance phénotypique aux antibiotiques des souches d’E. coli isolées. Les enquêtes ont révélées d’énormes insuffisances et défaillances sur l’hygiène de la préparation. Les résultats des analyses bactériologiques, sur 120 échantillons prélevés sur 120 carcasses bovines, ont permis d’avoir une idée sur le niveau de contamination superficielle des carcasses par E. coli au cours de leur préparation. Les résultats obtenus révèlent : - une prévalence de 99,17 % de portage d’E. coli par les carcasses échantillonnées ; - une moyenne de portage d’E. coli par ces carcasses de 3,01 log10 UFC/cm² +/- 0,80 ; - que l’échantillon le plus contaminé a un niveau de contamination supérieur à 5,18 log10 UFC/cm², la moins contaminée avec une contamination de 1 log10 UFC/cm². L’analyse des résultats a montré que le jeudi représente le jour on note les plus fortes charges bactériennes au niveau des carcasses. Cette contamination non négligeable des carcasses par ces germes, serait fortement liée aux méthodes de travail et secondairement à l’environnement du circuit de la préparation des bovins. L’analyse de l’antibiorésistance de 57 souches d’E. coli a montré une résistance de 32% à la tétracycline, de 26% à la colistine, de 12% à la céfépime et à la céfoxitine, de 11% à l’ampicilline, la gentamicine et l’amoxicilline +acide clavulanique, 9% à la kanamycine et la céftazidime, de 5% à la ciprofloxacine, de 4% à la céfalotine et de 2% à l’acide nalidixique. En revanche, aucune souche n’est résistante à la céfotaxime, l’imipénème et à la norfloxacine. Près de 15,80% de ces souches soumises à l’antibiogramme, sont qualifiées de multirésistantes, soit 9/57. Près de 42,10% d’entre-elles sont résistantes à deux classes d’antibiotiques, 36,84% résistantes à une classe et les 5,26% autres restants, sont sensibles à toutes les classes d’antibiotiques utilisés. Compte tenu de ces résultats, il devient indispensable d’améliorer les conditions et méthodes de travail sur toute la chaîne de production mais aussi de rationaliser l’utilisation des antibiotiques aussi bien en médecine humaine qu’animale. PRESIDENT DE JURY : Monsieur Djibril FALL DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Madame Bellancille MUSABYEMARIYA RAPPORTEUR : Madame Bellancille MUSABYEMARIYA MEMBRE : Monsieur Oubri Bassa GBATI CO-DIRECTEUR : Monsieur Luc LOUBAMBA DATE DE SOUTENANCE : 21/04/2021 PAYS : Sénégal Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=4700

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Prévalence et antibiorésistance des salmonelles dans les élevages avicoles des zones d’Abidjan et d’Agnibilekrou (République de Côte d’Ivoire) / Félix Nimbona (2015) 

Public ISBD Titre : Prévalence et antibiorésistance des salmonelles dans les élevages avicoles des zones d’Abidjan et d’Agnibilekrou (République de Côte d’Ivoire) Type de document : texte imprimé Auteurs : Félix Nimbona, Auteur Editeur : Dakar : EISMV Année de publication : 2015 Importance : 80 p. Note générale : Langues : Français (fre) Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2015 Mots-clés : ANTIBIORESITANCE  SALMONELLE  ANTIBIOTIQUE  MEDICAMENT  AVICULTURE  COTE D’IVOIRE Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : En aviculture, le développement de la résistance chez les bactéries responsables des zoonoses comme les salmonelles est à surveiller dans le contexte d’une approche de santé publique globale. A l’inverse des pays industrialisés, la surveillance des salmonelles et leur antibiorésistance en élevages ne sont pas obligatoires et ne font donc pas objet d’un suivi régulier en Afrique. Cette étude intervient en ce sens pour combler ces lacunes. L’objectif de cette étude est de déterminer la prévalence de la contamination des élevages avicoles par les salmonelles antibiorésistantes dans les zones d’Abidjan et d’Agnibilékrou en Côte d’Ivoire. Pour ce faire, 231 échantillons de fientes de volailles ont été prélevés à partir de 124 fermes dont 78 sont localisées à Abidjan. Ils ont été analysés suivant la norme ISO 6579:2002/Amd 1: 2007. Le sérotypage a été effectué au Centre National de Référence des salmonelles de l’Institut Pasteur de Dakar et le test de sensibilité aux antibiotiques suivant les recommandations du Comité de l’Antibiogramme de la Société Française de Microbiologie. Les résultats ont montré un taux de contamination des fermes de 24,19% (30/124) tandis que le taux d’isolement était de 13,85% (32/231). Trente six (36) souches de salmonelles ont été isolées avec six sérovars que sont : S. Kentucky (n=15), S. Sandiego (n=10), S. Djugu (n=3), S. Agama (n=3), S. Poona (n=3) et S. Mbandaka (n=2). Une seule (01) souche a été sensible à tous les antibiotiques testés, alors que 47.22% (n=17) et avaient une résistance contre 1 à 5 antibiotiques. Le reste, 50% (n=18), avait une résistance à plus de 5 antibiotiques. Des fortes résistances à la doxycycline (94,4%), aux sulfonamides (86,1%) et à la tétracycline (86,1%) ont été observées. Des recommandations ont été faites sur la base des résultats obtenus. PRESIDENT DE JURY : M. Alassane WELE DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Mme. Rianatou BADA ALAMBEDJI RAPPORTEUR : Mme. Rianatou BADA ALAMBEDJI MEMBRE : M. Malang SEYDI CO-DIRECTEUR : M. Abdou Moumouni ASSOUMY DATE DE SOUTENANCE : 29/12/2015 PAYS : BURUNDI) Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=1906 Prévalence et antibiorésistance des salmonelles dans les élevages avicoles des zones d’Abidjan et d’Agnibilekrou (République de Côte d’Ivoire) [texte imprimé] / Félix Nimbona, Auteur . - Dakar : EISMV, 2015 . - 80 p. Langues : Français (fre) Catégories : THESES DE MEDECINE VETERINAIRE:2015 Mots-clés : ANTIBIORESITANCE  SALMONELLE  ANTIBIOTIQUE  MEDICAMENT  AVICULTURE  COTE D’IVOIRE Index. décimale : TD-THESE DE DOCTORAT Résumé : En aviculture, le développement de la résistance chez les bactéries responsables des zoonoses comme les salmonelles est à surveiller dans le contexte d’une approche de santé publique globale. A l’inverse des pays industrialisés, la surveillance des salmonelles et leur antibiorésistance en élevages ne sont pas obligatoires et ne font donc pas objet d’un suivi régulier en Afrique. Cette étude intervient en ce sens pour combler ces lacunes. L’objectif de cette étude est de déterminer la prévalence de la contamination des élevages avicoles par les salmonelles antibiorésistantes dans les zones d’Abidjan et d’Agnibilékrou en Côte d’Ivoire. Pour ce faire, 231 échantillons de fientes de volailles ont été prélevés à partir de 124 fermes dont 78 sont localisées à Abidjan. Ils ont été analysés suivant la norme ISO 6579:2002/Amd 1: 2007. Le sérotypage a été effectué au Centre National de Référence des salmonelles de l’Institut Pasteur de Dakar et le test de sensibilité aux antibiotiques suivant les recommandations du Comité de l’Antibiogramme de la Société Française de Microbiologie. Les résultats ont montré un taux de contamination des fermes de 24,19% (30/124) tandis que le taux d’isolement était de 13,85% (32/231). Trente six (36) souches de salmonelles ont été isolées avec six sérovars que sont : S. Kentucky (n=15), S. Sandiego (n=10), S. Djugu (n=3), S. Agama (n=3), S. Poona (n=3) et S. Mbandaka (n=2). Une seule (01) souche a été sensible à tous les antibiotiques testés, alors que 47.22% (n=17) et avaient une résistance contre 1 à 5 antibiotiques. Le reste, 50% (n=18), avait une résistance à plus de 5 antibiotiques. Des fortes résistances à la doxycycline (94,4%), aux sulfonamides (86,1%) et à la tétracycline (86,1%) ont été observées. Des recommandations ont été faites sur la base des résultats obtenus. PRESIDENT DE JURY : M. Alassane WELE DIRECTEUR DE THESE OU MEMOIRE : Mme. Rianatou BADA ALAMBEDJI RAPPORTEUR : Mme. Rianatou BADA ALAMBEDJI MEMBRE : M. Malang SEYDI CO-DIRECTEUR : M. Abdou Moumouni ASSOUMY DATE DE SOUTENANCE : 29/12/2015 PAYS : BURUNDI) Permalink : ./index.php?lvl=notice_display&id=1906

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